Aerobní procesy: 60% energie na syntézu nové biomasy 40% energie se ztrácí ve formě reakčního tepla Anaerobní procesy: 90% energie zachováno ve vzniklém bioplynu 5-7% je spotřebována na nový růst biomasy 3-5% se ztrácí ve formě reakčního tepla
Bilance uhlíku
Aerobní procesy: 50% C ze substrátu přeměněno na biomasu 50% C substrátu v CO2 Anaerobní procesy: 95% C ze substrátu do bioplynu 5% C do biomasy
Z technologického hlediska představují anaerobní procesy energeticky málo náročné metody anaerobní stabilizace kalů a anaerobního čištění odpadních vod. Odstraněné jednotkové množství znečištění anaerobním způsobem je vždy ekonomicky výhodnější než aerobním způsobem.