Celkové výdaje na zdravotnictví dosáhly v roce 2006 cca 225 mld. Kč, což znamená, že oproti roku 2005 vzrostly o cca 4,2%. Výdaje na zdravotnictví členíme na veřejné a soukromé. Dle mezinárodní metodiky jsou za veřejné nebo-li nepřímé platby považovány výdaje státního rozpočtu, rozpočtů krajů a obcí a výdaje veřejného zdravotního pojištění. Do soukromých výdajů řadíme přímé výdaje domácností. Podíl zdravotních pojišťoven na financování zdravotnictví činil 80,1%, podíl veřejných rozpočtů 8,6% a soukromých výdajů 11,3%. V přepočtu na 1 obyvatele bylo celkem ve zdravotnictví vynaloženo 21 880Kč. Podíl výdajů na zdravotnictví na HDP osciluje v ČR v posledních letech kolem 7%, za rok 2006 to bylo 6,98%.