Projekt: Analýza biologických sekvencí
Skrýt detaily | Oblíbený- Kvalita:77,2 %
- Typ:Projekt
- Univerzita:Vysoké učení technické v Brně
- Fakulta:Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
- Kategorie:Technika
- Podkategorie:Elektrotechnika
- Předmět:Analýza biomedicínských obrazů
- Autor:nella.grundzova
- Ročník:4. ročník
- Rozsah A4:9 strán
- Zobrazeno:817 x
- Stažené:0 x
- Velikost:0,1 MB
- Formát a přípona:MS Office Word (.docx)
- Jazyk:český
- ID projektu:7599
- Poslední úprava:07.03.2016
Zadání
Vytvořte funkci pro vykreslení “nejlepšího“ fylogenetického stromu metodou UPGMA. Srovnejte Pearsonův korelační koeficient u stromů vykreslených pro model Jukes-Cantor s gama korekcí v rozmezí <0,65 - 3>. Výstupem bude strom vyhodnocený automaticky pro nejlepší korelační koeficient. Otestujte na 20 proteinových sekvencích Hemoglobinu (po pěti od každé skupiny: alfa, beta, gama, delta). Na každou skupinu zvlášť i na všech 20 dohromady.
Vytvořte funkci pro vykreslení “nejlepšího“ fylogenetického stromu metodou UPGMA. Srovnejte Pearsonův korelační koeficient u stromů vykreslených pro model Jukes-Cantor s gama korekcí v rozmezí <0,65 - 3>. Výstupem bude strom vyhodnocený automaticky pro nejlepší korelační koeficient. Otestujte na 20 proteinových sekvencích Hemoglobinu (po pěti od každé skupiny: alfa, beta, gama, delta). Na každou skupinu zvlášť i na všech 20 dohromady.