Biogeochemickými cykly se rozumí výměna látek mezi organismy a biotickým prostředím a uskutečňují se v celé biosféře. Pro funkci ekosystému má větší význam rychlost koloběhu než množství živin. Biogeochemické cykly jsou trojího typu: 1. Koloběh vody v přírodě (hydrologický cyklus), velký a malý 2. Plynný typ koloběhů, kde hlavním zásobníkem je atmosféra. Tyto cykly jeví pouze velmi malé nebo žádné změny v množství a rozložení prvků. 3. Sedimentární typ koloběhů, hlavním zásobníkem živin je litosféra, z níž se uvolňují zvětráváním.