Indikace k mikrobiologickému vyšetření: a. vyloučení mikrobiální kontaminace masa a orgánů b. objasnění příčin onemocnění zvířete
Jde o případy: • podezření na infekci masa a masných výrobků mikroorganismy patogenními pro člověka nebo zvířata • horečnatých onemocnění • bakteriální onemocnění, zejména zažívacího traktu nebo porodních cest • septických nebo pyemických procesů s narušením celkového zdravotního stavu • nutné porážky zvířete, u kterého nebylo provedeno vyšetření ante mortem • chybějících orgánů nebo části JOT • opožděného vykolení • nedostatečného vykrvení