Registrace | Přihlásit

Státnicové otázky: Vypracované státnicové otázky - Programování v bioinformatice

Skrýt detaily | Oblíbený
Náhledy Náhledy Náhledy
FPRG, otázka 1: Číselné, komplexní a vektorové reprezentace genomických a proteomických dat

Dělení nukleotidů:
• Puriny: A, G
• Pyrimidiny: C, T

Párování:
• C-G, silná vazba, 3 vodíkové můstky
• A-T, slabá vazba, 2 vodíkové můstky

Numerická mapa - soubor pravidel (konvencí), podle kterých je jednotlivým nukleotidům přiřazována numerická hodnota.
Požadavky na ideální numerickou mapu:
• Nedochází k zavedení nové informace ani ke ztrátě existující informace
• Čitelná pro lidského operátora
• Umožňuje rychlé zpracování
Nukleotidový čtyřstěn (3D reprezentace)
Jednotlivé osy reprezentují vlastnosti nukleotidů: síla vazby, purin/pyrimidin, keto/amino
A = (1,1,1)
C = (-1,1,-1)
G = (-1,-1,1)
T = (1,-1,-1)
Hodnocení (0x):