Numerická mapa - soubor pravidel (konvencí), podle kterých je jednotlivým nukleotidům přiřazována numerická hodnota. Požadavky na ideální numerickou mapu: • Nedochází k zavedení nové informace ani ke ztrátě existující informace • Čitelná pro lidského operátora • Umožňuje rychlé zpracování Nukleotidový čtyřstěn (3D reprezentace) Jednotlivé osy reprezentují vlastnosti nukleotidů: síla vazby, purin/pyrimidin, keto/amino A = (1,1,1) C = (-1,1,-1) G = (-1,-1,1) T = (1,-1,-1)