Významné evoluční novinky skupiny Gnathostomata, srovnání s „Agnatha“. Významné synapomorfie čelistnatců: 2x duplikace homeoboxových genů, přeměna žaberních oblouků (z dýchání na žraní) , žaberní oblouky uvnitř žaber, párové končetiny, párové nozdry, 3 polokružné chodby, nervy s myelinovou pochvou, cerebellum, „pravé“ obratle s těly, žebra, hypobranchiální svalovina, conus arteriosus (vyrovnávání tlaku - pulsace) , žaludek, slezina, slinivka, spirální střevní řasa, samostatné vývody pohlavních buněk, Významné apomorfie čelistnatců: celulární kost (osteocyty až do dospělosti)